Yedekleme, sistemin kendi güvenlik seviyesini etkilemez, ancak bir güvenlik krizinden sonra kayıp verilerin kurtarılması gerektiğinde yedekleme çok önemlidir. Bazen, bir yedeklemeye dayanarak, sistemdeki güvenlik açıklarını veya hataları yeniden yapılandırarak sistem çökmesinin nedenini belirlemek mümkündür. UrBackup gibi açık kaynaklı bir yedekleme sisteminin kullanılması tavsiye edilir. Seçim yaparken, yedekleme sisteminin verileri hızlı ve doğru bir şekilde geri yükleme yeteneği sağlamasına ve optimum olmasına, yani sunucuya veya depolama kaynaklarına aşırı yüklenmemesine dikkat edilmelidir.

Verilerinizin yedeklenmesi söz konusu olduğunda takip edilmesi gereken temel öneri "3-2-1" kuralıdır: verilerinizin en az 3 kopyasını saklayın, iki kopyanın ayrı cihazlarda veya depolama birimlerinde saklandığından emin olun ve bir kopyanın ilk iki kopyadan farklı bir yerde, örneğin uzak bir sunucuda saklandığından emin olun.

Yedekleme konusunda dikkat edilmesi gereken bir diğer önemli husus da bulut depolama sağlayıcılarının (Proton Drive, Dropbox, Tresorit vb.) verileri güvenli bir şekilde saklamak için yaygın ve güvenli bir çözüm olmasına rağmen sosyal mühendislik ve benzeri saldırılara karşı savunmasız olabilmeleri ve çeşitli nedenlerle verilerin kaybolmayacağını garanti etmemeleridir (örneğin masaüstü kullanıcıları için Google Drive'ın 2023 yılının sonlarında aylarca veri kaybettiği bildirilmiştir). Bu durum göz önünde bulundurularak, harici bir sabit diskte veya başka bir bilgisayarda çevrimdışı yedekleme yapılması da ek bir önlem olarak teşvik edilmektedir.