Е-поштата се смета за чувствителен податок во секоја организација. Поради тоа, од клучно значење е да се обезбеди заштита на серверот за е-пошта од напади и од други злонамерни активности.

Покрај содржината на е-поштата, важни се и метаподатоците што се создаваат во секојдневната комуникација. Се работи за информации што се создаваат и разменуваат од софтверот и од уредите кои се користат за испраќање и примање е-пошта.

Ако ги прашате напаѓачите, за нив метаподатоците најчесто се многу поважни од содржината на текстот во електронската пошта, бидејќи содржат точни информации за дигиталниот контекст на комуникацијата. Метаподатоците се чуваат на серверот за електронска пошта и затоа нивната заштита е специфична. Во овој случај, основен чекор е да се блокираат сите протоколи (на пример, FTP или HTTP), што на серверот не му се потребни за извршување на својата примарна функција, т.е. примањето и испраќањето електронски пораки. Алтернативно, може да се изнајми и посебен сервер во рамките на хостинг пакет или на други услуги. Исто така, организацијата може да купи сервер што ќе располага со специјален софтвер. Пример за таков софтвер е iRedMail.

Алтернативно, организациите можат да се префрлат на Proton for Business, решение за енкриптирана (шифрирана) е-пошта, кој нуди специјални цени за непрофитни организации.